Die Knabstruper Zucht geht zurück auf eine grau gefleckte spanische Stute Flaebehoppen, die im Napoleonischen Krieg zurückgelassen und mit einem Frederiksborger Hengst gedeckt wurde. Die Knabstrupper waren eine Farbvariante der dänischen Frederiksborger. Mann nante sie nach dem Gut Knabstrupp, wo seit 1798 Tiegerschecken gezüchtet wurden.

Es gibt heute nur noch 700 bis 800 Knabstrupper (wovon ein großer Teil Ponys mit Tiegerscheckung sind, also keine richtigen Knabstrupper) Der größte Populationsanteil des dänischen Pferdes lebt in Deutschland, wo große Anstrengungen unternommen werden um die Rasse vor dem Aussterben zu bewahren. Der sanfte Knabstrupper konnte sich die Intelligenz und Härte seiner Vorfahren bewahren, was ihn, in Verbindung mit seiner auffallenden Färbung, zu einem beliebten Zirkus- und Schaupferd werden ließ.